包衣种子若有多余，经农药型种衣剂处理的，一般不宜长期贮藏，且不安全，需深埋销毁；而生物型种衣剂处理的则可贮存一个播种季节，或用水浸泡冲洗后转作饲料用。生物型包衣种子在常温库贮藏，可用“井”字型堆垛法。试验表明：种子含水量在安全贮藏水分含量内，包衣的和未包衣的种子在常温库贮存一年后，两者播种品质无明显差异。生物型包衣种子在贮存时，最好使用无孔塑料袋包装，其次是有孔塑料袋，再次是麻袋。