栗属植物cpSSR标记技术的建立与体系优化
来源:果树学报 作者:甄 贞 曹庆芹 杨 凯 沈元月 冯永庆 秦 岭 日期:2007-04-01
摘 要:叶绿体微卫星标记是一种新的分子标记技术。用1对来源于拟南芥的cpSSR引物研究栗属资源,对栗属植物cpSSR反应体系的主要影响因子进行了优化筛选。结果表明,20 μL反应体系各组分的最适浓度分别为:2.5mmol/LMg2+,0.5 u Taq DNA聚合酶,0.25 mmol/L dNTP,10 mg/L的DNA模板,正向引物和反向引物都为0.1 μmol/L,NTCP40最适退火温度为56 ℃。该体系已成功应用于栗属资源的遗传多样性研究中。
关键字:栗属植物;cpSSR;体系优化
中图分类号:S664.2 文献标识码:A 文章编号:1009-9980(2007)04-557-04
现代分子生物学技术的迅速发展,为在DNA水平上研究板栗种质遗传多样性提供了有效的技术手段,同时为栗属植物起源和分类研究提供了新的思路。cpSSR(Chloroplast simple Sequence Repeat,叶绿体简单序列重复)标记技术,是在SSR标记技术基础上发展起来的新的DNA分子标记技术。它具有SSR标记的优点又兼顾到叶绿体基因组的特点,被广泛应用于植物群体遗传分析及系统发育分析的研究中。但由于其引物来源受限,高等木本被子植物中的应用仅在猕猴桃阁、柑橘类和欧洲栗等果树中有报道。未见有cpSSR标记用于其它栗属资源的研究报道。本实验对各个因子的最佳反应条件进行了摸索,建立了适合于板栗等栗属植物的cpSSR反应体系。
“注:本文中所涉及到的图表、注解、公式等内容请以PDF格式阅读原文”
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